علی خامنه‌ای، رهبر ایران، در پاسخ به درخواست حسن روحانی، رئیس جمهور این کشور، برای استفاده از منابع صندوق توسعه ملی در جبرات خسارت‌های سیل، مجوز برداشت از این صندوق را به آینده موکول کرده است. رهبر ایران در پاسخ به درخواست رئیس جمهور گفته است که از منابع دیگر برای رسیدگی به سیلزدگان استفاده شود، و "در ادامه پس از جمع‌بندی وضعیت، در صورت نیاز، برداشت از صندوق مزبور مورد تأیید این‌جانب خواهد بود." رهبر ایران به آقای روحانی یادآوری کرده که "مطلعید که استفاده از صندوق توسعه ملی صرفاً در صورت مسدود بودن راه‌های دیگر ممکن است." او خواهان آن شده است که فعلا از ظرفیت پنج درصد بودجه عمومی برای حوادث غیرمترقبه، جابجایی بودجه‌های پروژه‌های عمرانی موجود و بیمه‌ها و تسهیلات بانکی برای جبران خسارت‌های سیل استفاده شود. تخمین رسمی از خسارت سیل‌های اخیر ایران به ۳۵ هزار میلیارد تومان می‌رسد. رهبر ایران در اواخر سال ۹۶ مجوز داد که دو و نیم میلیارد دلار از این صندوق برای "تقویت بنیه
دفاعی" برداشته شود. در اواخر سال گذشته خورشیدی نیز خبر داده شد که او برای برداشت یک و نیم میلیارد دلار دیگر از صندوق توسعه ملی مجوز داده تا صرف "تقویت بنیه دفاعی" شود